谈起Plink相信熟悉的人更定都会知道,这是一个全面的基因组分析工具集,具有很多的小功能,在SNP数据统计,过滤,GWAS分析中都可以用得上,而...
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谈起Plink相信熟悉的人更定都会知道,这是一个全面的基因组分析工具集,具有很多的小功能,在SNP数据统计,过滤,GWAS分析中都可以用得上,而...
此教程写给像博主一样的小白,欢迎各路大神批评指正 GWAS GWAS全称“全基因组关联分析”,使用统计模型找到与性状关联的位点,用于分子标记选择...
找到Matrix eQTL这个包,看下文章Matrix eQTL: ultra fast eQTL analysis via large mat...
1、群体结构及其对 GWAS 的影响 群体结构的来源image.png群体结构对GWAS的影响--混淆变量Ancestry可以导致混淆变量(co...
基因组注释(Genome annotation) 是利用生物信息学方法和工具,对基因组所有基因的生物学功能进行高通量注释,是当前功能基因组学研究...
多基因风险评分是一个用来评估个体患某种疾病风险的方法,它是通过GWAS统计数据的基因型效应值来计算的。计算公式如下: n: 纳入的SNP的数量;...
在硕士就读期间,就已经做过 GWAS 相关的分析。当时标记量非常少, windows 系统分析就足够了,作图方面涉及的脚本也基本是蔡师兄帮写的。...
1、GWAS 流程 image.png数据质控• 1)按分型百分比条件过滤,多数文章剔除缺失率在20%以上的位点,样本量较大的群体中,可以将缺失...
专题公告
原理流程结果分析