需要准备的内容: 环境:Linux 或 Ubuntu,已经安装openjdk 文件:通过 GATK 流程得到的变异或者 VCF 格式的文件 参考...
收录了4篇文章 · 4人关注
需要准备的内容: 环境:Linux 或 Ubuntu,已经安装openjdk 文件:通过 GATK 流程得到的变异或者 VCF 格式的文件 参考...
1 软件准备 bwa samtools bcftoolspicard psmc 2 数据准备 二倍体物种(该分析是结合杂合度来分析的)!! Re...
首先肯定是要call SNPs的,最好用bcftools pileup,避免后面报错 可以用一个管道一次性搞定: 也可以先call出VCF文件:...
bwa mem比对出现:skip orientation RF as there are not enough pairs mapping生成s...
专题公告
重测序分析详解与脚本