导读 用MUMmer，做比较基因组，比对完后用mummerplot做可视化踩了三个坑。MUMmer软件包中五个常用的程序：mummer, nuc...
投稿
收录了11篇文章 · 1人关注
-
基因组共线用MUMmer
-
「基因组学」使用CAFE进行基因家族扩张收缩分析环境准备 安装软件: 参考「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析 安装OrthoFinder，然后再安装CAFE 数据准备...
-
物种分歧时间的估计以及基因家族的收缩与扩张
0.软件的安装略1.物种树的构建参见 https://www.jianshu.com/p/336b65ca1b67[https://www.ji...
-
八行代码搞定内参基因筛选-R版本的NormFinder写在前面 硕士毕业做的大豆内参基因的筛选，当时用了geNorm, NormFinder和BestKeeper三个软件，geNorm 不需要多说，...
-
内参基因筛选在线版GeNorm和NormFinder工具发布作者：ahworld链接：内参基因筛选在线版GeNorm和NormFinder工具发布[https://mp.weixin.qq.com/s/K...
-
R语言：gggenes在基因组中画基因箭头图导读 gggenes: Draw Gene Arrow Maps in 'ggplot2'。 Github：gggens[https://git...
-
R语言gggenes包，基因组箭头图R语言gggenes包，基因组箭头图
-
跟着Nature Genetics学画图：R语言ggbio包画基因结构图论文是 Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cu...
-
我的挣扎 与 TBtools 的开发到底还是写了一篇推文，却着实想不到一个合适的题目。可能这是我写过最长的一篇推文，约莫万字。这篇推文的主要内容应该包括： TBtools 开发为了...
-
实用 | 优雅地提取部分基因结构注释信息写在前面 很久很久以前，我就已经写过 GFF3/GTF 注释信息的部分提取功能。每一个GXF文件，往往包含的两万个左右基因（数万个转录本）的外显...
专题公告
基因家族
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1983511/crop1648647557376.jpg', '推荐专题《基因家族》（ 分享自 @简书 ）','https://jianshuapi.com/c/643e06ab5840?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','页面编码gb2312|utf-8默认gb2312'));){kind=link}