1.1 我们要将上游处理得到的the methylation call files转换为methylKit这个R包可以识别的格式 该文作者写了三...
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WGBS 下游处理-Package methylKit -
Whole Genome DNA Methylation Analysis Pipeline 第一部分（上游处理-MethPipe）一、介绍 首先声明，本文注重流程的梳理和生物学意义的解答，具体软件的原理和参数的运用请参照MethPipe软件手册（和我未来的翻译） 本文使用B...
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人基因组版本的对应关系：演变的记录
我经常需要复习版本对应的时候来看这个；希望对你也有帮助 From 谌于蓝：2019.9
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利用plink对snp质控的指标和基本流程
在拿到一组snp数据时，首先应该想到要对snp数据的质量进行检测和控制。然后再考虑这组数据该怎么分析，如何分析。snp的质控是非常重要的，如果s...
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GATK-参数
我应该如何正确设置GATK VQSR的模型训练参数？ | 《解螺旋技术交流圈》精华第4期 碱基矿工2018-07-29 今天，只分享一个精选内容...
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【文献】单细胞转录组测序技术与生物信息流程综述【文献】Single-cell RNA sequencing technologies and bioinformatics pipelines...
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详解如何获取物种所有基因对应的GO注释
欢迎关注”生信修炼手册”! Gene Ontology是研究基因功能的重要数据库之一，在进行GO的富集分析时，需要提供所有基因对应的GO注释信息...
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[数据库] KEGGKEGG 参考资料：5分钟看懂KEGG代谢通路图读研笔记: KEGG学习笔记GEO数据挖掘小尝试：（三）利用clusterProfiler进行富...
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MethyIC-Seq是什么？和BS-Seq的关系是什么？
从根本上说，MethylC-Seq技术实际上就是Bisulfite Sequencing (BS-Seq)方法的优化版本。或者谈不上优化，个人理...
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Bioconductor做生信分析入门介绍（上）这是我听B站鲮鱼不会飞视频（R与Bioconductor的入门课）里的笔记哦~ Bioconductor是什么？ Bioconductor是一个...
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