最佳线性无偏预测 (BLUP) BLUP (Best Linear Unbiased Prediction) ，在线性混合模型中可以用来评估随机...
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全基因组关联分析流程 ( 二 )
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玉米全基因关联分析 ( GWAS Analysis Pipeline )全基因组关联分析是基于数量性状连锁不平衡理论，通过表型与基因型关联分析获得影响表型性状的显著关联标记。 1. 软件 Tassel / Gaipt...
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全基因组关联分析流程（三）拿到结果后，我们对结果进行展示，一般 GWAS 的标准结果图为 曼哈顿图 和 QQ 图，作图代码如下： 数据示例入下： END
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GWAS：混合线性模型分析多性状GWAS（MTMM）
原文下载 文章 数据及代码下载 MTMM Korte A, Vilhjálmsson B J, Segura V, et al. A mixed...
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关于全基因组关联分析（GWAS）
全基因组关联分析是一种在人类或动植物全基因组中寻找变异序列的方法，全英文名为Genome-wide association study，缩写名为...
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2018-11-06 GWAS实战（七）plink 进阶之关联分析这一节说的是association analysis 也是我们分析单标记回归得到的结果（P值）的一步，这一步的结果可以用来与我第一讲 联合起来，...
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2018-11-05 GWAS实战（六）plink 进阶之主成分分析和群体分层要学习这一节，首先是要学习什么是主成分，什么是聚类这个我一直有点搞混，可以百度谷歌查一查http://www.cnblogs.com/pinar...
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2018-11-02 GWAS实战（五）plink 进阶之数据过滤一条命令
之前讲了太多的很细的数据分析和过滤，在实战中，一般可以把命令写在一起。 这张图片对比了数据summary和数据过滤的命令之间的差异。 对于我们自...
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2018-11-01GWAS实战（四）plink 进阶之数据过滤数据好不好，影响到结果的准确性，所以我们要来对数据进行过滤，过滤前，我们应该对数据的部分特征进行统计描述，以此为依据来进行过滤。 这里介绍的几个...
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2018-10-31 GWAS实战（三）plink 进阶之认识常用文件格式学会了基本的plink之后，就要开始学习了解输入文件的格式了。详细的格式建议看官网因为之前以及接触过几次，这里来个详细的归总主要认识 ped m...
专题公告
gwas实际操作
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