Luecken MD, Theis FJ. Current best practices in single-cell RNA-seq anal...
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sc-Review：单细胞RNA-seq数据分析最佳实践 -
单细胞转录组学习笔记-13-差异分析及KEGG注释简介
刘小泽写于19.8.7-第二单元最后一讲：差异分析及KEGG注释简介笔记目的：根据生信技能树的单细胞转录组课程探索smart-seq2技术相关的...
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单细胞转录组数据分析||Seurat 3.1 ：UMAP的两种实现方法Warning: The default method for RunUMAP has changed from calling Python ...
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单细胞Seurat包升级之2,700 PBMCs分析（下）刘小泽写于19.8.19主要介绍官方教程PBMC 3K的下游分析（https://satijalab.org/seurat/v3.0/pbmc3...
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重新认识TBtools，减少你的生信分析烦恼（20190422）写在写在前面的前面 或许，没有人知道TBtools到底是什么？能干啥。但是看完这个推文，或许你就知道了其中的一部分。 写在前面 TBtools对...
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富集分析DAVID、Metascape、Enrichr、ClueGO前言 一般我们挑出一堆感兴趣的基因想临时看看它们的功能，需要做个富集分析。虽然公司买了最新版的数据库，如KEGG，但在集群跑下来嫌麻烦。这时网页...
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单细胞软件安装和测试刘小泽写于18.9.29上一次是理论知识和准备工作，这次开始软件安装和测试 软件安装和检测 cellranger这个软件内容十分丰富，整合了大量...
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10X cellranger 报错解决办法越来越多的同学开始自己尝试做10X单细胞转录组数据分析了，除了Linux的基本命令之外，首先用到的软件是cellranger。失败是成功之母，对...
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CellRanger走起(四) Cell Ranger流程概览刘小泽写于19.5.7主要看流程，这一篇不涉及真实数据展示 总的来说，Cell Ranger主要的流程有：拆分数据 mkfastq、细胞定量 c...
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CellRanger走起(三) 使用初探刘小泽写于19.5.6 首先对上次改好名称的fastq数据进行质控 然后利用Filezilla下载其中SRR7722937的R1、R2的html...
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