最近在复习HGVS命名，当做个人翻译笔记吧。 HGVS，全称是Human Genome Variation Society，人类基因组变异协会的...
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HGVS命名之【缺失】Deletion -
NCBI参考序列登录号标识符（NC_,NG_,NM_,NR_……）
RefSeq accession numbers and molecule types. 来源：https://www.ncbi.nlm.nih...
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TCGA数据库(GDC Data User's Guide)学习1. Introduction GDC(Genomic Data Commons, 基因组数据共享中心)接收、处理和分发来自癌症研究项目的基因组...
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用泊松分布解释 NGS 测序数据的 duplication 问题
tags： NGS duplication 不管从哪个角度看我们都希望测序仪产出的数据中 duplicate 率尽量低。怎样降低 duplica...
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讨厌又迷人的reads去重复在NGS分析入门阶段，我们不需要考虑太多的细节，只用知道一个分析的大致流程并完整跑下来即可。太多的细节，只会让我们对于分析产生莫须有的恐惧，因此...
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如何用conda安装软件|处理conda安装工具的动态库问题阅读完本文后，请看这一篇慎用Anaconda进行软件管理 conda的确是一个非常好的工具，对于初学者而言，安装软件就跟用XXX软件管理器一样方...
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测序的PCR duplicates - II（转载）
这一次的资料给出了详细的计算公式，并且有R做模拟验证的code。 在我实际处理NGS data时候，从测序数据中自己写脚本remove PCR ...
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测序的PCR duplicates - I（转载）在做NGS data处理的时候，常常会遇到需要使用picard和samtools 进行remove PCR duplicates的步骤。在网上查...
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ChAMP 包分析甲基化数据参考：https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ChAMP/inst/d...
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我的ChIP-Seq(2): cutadapt/fastp/Trimmomatic 过滤软件选择过滤软件的比较与选择：cutadapt/fastp/trimmomatic 注：还没有完全搞明白，先总结一下特点和使用，之后再慢慢体会、总结经验...
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