使用DEseq2循环做多组间差异表达分析 当有多组RNA-seq数据时，有时需要对多个组合进行差异表达分析，例如当我有CIM0/CIM7/CIM...
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RNA-seq分析流程二：DEseq2做不同组间差异表达分析 -
GeneToList – 基因名转换网络服务器小编写过有关基因名的坑的推文，总结了有关基因名的十大坑，见：。今天为大家推荐一款很不错的基因名转化在线服务器 – GeneToList 随着高通...
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bulk RNA-Seq（9）富集分析欢迎关注Bioinfor 生信云！ 这一期我们来讲讲富集分析。 构建OrgDB OrgDB是bioconductor中存储不同数据库基因ID之间...
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GFF文件和基因组文件提取mRNA,cds,protein序列首先是用gffread提取cds序列,蛋白序列,转录本序列 接下来我们利用组合工具来提取mRNA,和gene序列 注意用bedtools提取序列...
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从gtf提取ENSEMBL ID和transcript ID以及SYMBOL对应关系做可变剪切分析时，会依次进行基因水平和转录本水平的差异分析，最后通常需要进行ENSEMBL ID和 transcript ID (ENSEMBL...
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RNA-Seq从入门到放弃
本篇推文用于新手清晰了解并掌握植物RNAseq数据分析流程 一、测序数据的介绍 测序数据主要有两个来源 1、自测的测序数据；2、SRA数据库下载...
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RNA-Seq测序数据分析和差异表达基因鉴定，注释本文是由比利时列日大学Marc HANIKENNE课程整理。陆陆续续花费1个月完成，根据需要做的主要内容分为四个部分。第一部分：将RNA-seq...
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RNASeq实战练习-hisat2比对与featurecounts定量
hisat2 构建索引 hisat2 比对 hisat2 比对软件将 reads 比对到参考基因组[https://www.jianshu.co...
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使用Cytoscape中的Enrichmen进行富集分析可视化tMapEnrichment Map是一个用于功能丰富可视化Cytoscape软件的插件,必须使用任何可用方法在EnrichmentMap之外生成富集结...
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enrichplot||基因富集结果可视化解决方案enrichplot包实现了几种可视化方法来帮助解释富集结果。它支持从DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler...
专题公告
转录组数据分析可视化
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