在《WGBS 全基因组甲基化测序》)讲解了 WGBS 测序原理，简而言之是 BS 处理将未甲基化 C 转化为 U(T) 而甲基化的 C 不变，从...
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Bismark 进行 WGBS 比对 -
WGBS 全基因组甲基化测序DNA甲基化是DNA被添加甲基()修饰影响基因功能或者表达。最常见的甲基化是胞嘧啶产生5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine, 5-m...
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甲基化测序 （WGBS/RRBS/TBS）的去重（de-duplication）问题
关于测序数据去重问题网上有很多大神的分析，我就不滥竽充数了，我挑取了几篇比较好的文章: 第二代测序原理的详细解析！高通量测序之duplicate...
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DNA甲基化测序数据处理（二）：差异分析前言 衔接上一篇数据比对后的结果，使用R包DSS进行处理。 Input文件准备 我们先来复习一下上一节课得到的数据结果：*.bismark.co...
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DNA甲基化测序数据处理（一）：数据比对前言 因为组里面出了一批甲基化测序数据，使用的技术为BS-seq，处理的时候顺带记录了学习过程，演示使用数据为官方提供的example.fast...
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