0.需求解读 这是富集分析比较常见的一个图,左图右表。 图的最外层是GOterm的编号,中间灰色背景层表示基因的logFC分布,可以看到每个te...
收录了7篇文章 · 29人关注
0.需求解读 这是富集分析比较常见的一个图,左图右表。 图的最外层是GOterm的编号,中间灰色背景层表示基因的logFC分布,可以看到每个te...
材料:一个只有gene name的表格 需求:KEGG富集分析 背景 功能富集分析:按照功能分类,将功能相近的基因/蛋白分到一起,并关联其生物学...
刘小泽写于2020.2.6最近再一次做起了转录组,但这一次需求有点小改变,需要自己定制一下,具体原因看本文吧。其中要特别表扬花花💏同学,帮了个大...
目录 一、介绍 在进行生物学实验或者生物信息的学习中,都会听说KEGG富集分析,而且该方法在高通量测序分析中已然成为数据分析中必不可少的一环。 ...
回顾 首先对基因表达分析(上)做一个简单的回顾 研究基因表达的有如下工具:RNA-Seq,microarray, qRT-PCR等(欢迎补充) ...
topGO手册中的实例实现 手册地址:http://bioconductor.uib.no/2.7/bioc/vignettes/topGO/i...
关于三个工具的具体描述(尤其GOrilla),见 GO富集分析-对比Gorilla, clusterProfiler, topGO三种工具par...
专题公告
GO富集分析思路与代码