通过单拷贝基因构建物种树,一般有两种方法: 1,Concatenation(串联法):将比对完成的单个单拷贝基因依次串联成一个超级基因(supe...
通过单拷贝基因构建物种树,一般有两种方法: 1,Concatenation(串联法):将比对完成的单个单拷贝基因依次串联成一个超级基因(supe...
看了文献,拿到了数据,大体也明确了自己应该要做什么内容。而在开始写作之前,论文实验数据的处理是必不可少的。实证类论文需要先把实验结果跑出来,调研...
原文:转录组组装软件:Trinity视频参考:BroadE: Trinity - How it works和基因课的转录组原理的trinity原...
个人博客原文地址 基本原理 [站外图片上传中...(image-38780a-1577372733833)]原始群体中,遗传多样性是十分高的,整...
SeqKit的学习 --20191017 软件的介绍 SeqKit是一种跨平台的、极快的,全面的fasta/q处理工具。SeqKit为所有的主流...
写在前面 前天,在学位论文的完善中,有两个疑似ERF成员始终令我困扰。植物转录因子中有个超家族AP2,包括两个亚家族,一个也叫AP2,另一个叫E...
前几天,实验室的师弟师妹通过本地blast获取一些没有基因组注释物种的蛋白编码序列。原本以为可以快速地进行下一步的选择压力分析,没想到却在多序列...
首先,一般我们分析水稻的数据时候,选用的是MSU和RAPDB这两个数据库的genome和gtf文件,这里只介绍MSU的ID,RAPDB的同理。 ...
以下参照 hoptop的「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析这篇帖子试跑了一遍 1.软件安装 2.数据准备 下载「基因组学...
环境准备 安装软件: 参考「基因组学」使用OrthoFinder进行直系同源基因分析 安装OrthoFinder,然后再安装CAFE 数据准备...