表达矩阵的归一化和标准化，去除极端值，异常值 今天在学习转录组知识，在进行做表达量热图时候发现表达量差值很大，于是上网查资料看到关于解决问题的方...
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表达矩阵的归一化和标准化，去除极端值，异常值 -
如何构建表达矩阵——RNAseq中游分析
中游分析这个词是我杜撰的，用来强调表达矩阵构建过程并不简单。 0 前言 前几天Jimmy老师发了一篇 我用这个技能一杯咖啡的功夫就挣了800块钱...
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【分享】使用limma、Glimma和edgeR，RNA-seq数据分析易如反掌原文来自这里，略编辑 摘要 简单且高效地分析RNA测序数据的能力是Bioconductor的核心优势。 RNA-seq分析通常从基因水平的序列计...
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「学转录组入门生信」四周实战总结在四周之前，我写了一篇推送一个月能通过转录组入门生信吗？，于是开启了我的‘四周通过实战入门转录组’计划。现在四周结束了，我对这个计划进行一个阶段...
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无参转录组序列组装 — Trinity转录组分析策略 转录组分析策略根据有无参考转录组可以分为两类： 有参比对—定量—差异分析—功能富集分析等 无参组装—定量—差异分析—功能富集分析...
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「学转录组入门生信」第一周从环境配置开始
我们第一周目标有三个: 熟悉Linux环境登录服务器Linux基本命令PATH的意义 学习conda管理环境如何在conda中添加channel...
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生信技能树线上课程：RNA-seq写在前面 很荣幸参加生信技能树全国巡讲-第一站-重庆站的RNA-seq线下培训课程。以下为线下课结合线上课所做的笔记，希望能帮到你。 一些小练习...
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为什么说FPKM和RPKM都错了？
这本是三年多之前我发在公众号上的一篇旧文，一些偶然的机会，发现不少朋友也在讨论这个问题，因此我重新做了梳理并发出来。这样的讨论是有益的，放在今天...
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在线平台如何做单细胞测序分析全套？有它so easy!在线工具也能追上单细胞 作者：白介素2 单细胞测序技术是一个越来越Popular的技术，这不前两天还有小伙伴来找白介素同学，说是老板想分析单细胞...
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4️⃣ 核酸序列特征分析(1):开放阅读框识别序列比对和序列特征分析总目录 阅读框Open Reading Frame，ORF ORF指的是DNA上的序列，从5'端翻译起始密码子ATG到终止...
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