介绍 一致性聚类是一种为确定数据集中可能的聚类的数量和成员提供定量证据的方法，例如作为微阵列基因表达。这种方法在癌症基因组学中得到了广泛应用，在...
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一致性聚类ConsensusClusterPlus -
可视化文章集锦(套路、配色、编辑、在线工具、R、CIRCOS、Cytoscape)
数据可视化是解析、理解和展示数据不可缺少的一部分。炫或不炫看个人喜好和功底，能否达意是最基本的要求---最合适的图示和配色表达最直观的含义。 本...
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定量蛋白组生信分析主要来源于诺禾公司文件学习笔记，略有修改，侵权删！ 1）蛋白功能注释 目前提供注释的通用功能数据库主要有 GO、KEGG、COG 等。通过利用这...
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TCGA视频课程笔记（上）TCGA-101-课程介绍-需要哪些背景知识 基于TCGA28篇教程 掌握以下基础知识： 概念、研究范围、数据来源、数据存储、数据格式、癌症相关...
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通过整合生物信息学分析辨认TNBC的重要基因和通路部分代码见：https://www.jianshu.com/p/3553220509d7原文名称：Identification of Key G...
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基因家族分析 | 基因家族成员鉴定(hmm模型＆同源blast)方法一：基于hmm模型的鉴定方法 1.准备数据①下载拟南芥基因组fasta文件、注释文件gtf/gff3文件：ftp://ftp.ensembl...
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多重检验的目的和方法
目的： 多次检验导致的大量假阳性1. 如果是小概率事件（< 5%），我们就抛弃了最初的美好假设（H0：没有差异），认为观测的和预期不一样（接受H...
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WGCNA典型文章解析及视频教程WGCNA其译为加权基因共表达网络分析。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module)，并探索基因网络与关注的表型之间的关联，以及网络中的...
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典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - 数据获取到标准化GEO是当今最大、最全的公共基因数据资源库，包括基因的表达、突变、修饰等信息，涵盖几乎所有的疾病，且单个实验检测样品数目较多，是我们分析、学习的...
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从CNV到FPKMCreate: 2019-03-14 在看CONTRA的脚本，了解CNV分析方法，顺带查找一下其他的CNV分析软件，就看到了FishingCNV...
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