https://www.jingege.wang/2020/05/29/mfuzz%E5%8C%85%E8%BF%9B%E8%A1%8C%E6%...
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2021-01-10关于Mfuzz时间序列分析几点思考
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clusterProfiler优雅对非模式物种进行KEGG富集分析
最近在写进行转录组数据的分析文档，前面介绍了如何根据差异基因绘制火山图，今天来介绍如何通过clusterProfiler包对非模式物种进行KEG...
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RNA-Seq从入门到放弃
本篇推文用于新手清晰了解并掌握植物RNAseq数据分析流程 一、测序数据的介绍 测序数据主要有两个来源 1、自测的测序数据；2、SRA数据库下载...
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使用Trinity进行转录组组装Trinity是Broad Institute和Hebrew University of Jerusalem开发的RNA-Seq数据 转录组组装...
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RNA-seq摸索：2.sra下载数据→fastqc质控→hisat2/bowtie2/STAR/salmon比对→Samtools格式转换→IGV可视化结果参考这些主要根据这篇操作！！！[https://www.jianshu.com/p/970012d1b051/]💥💥💥我觉得学RNA-seq必看...
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RNAseq转录组分析流程：fastp+hisat2+samtools+featureCounts+DESeq2
使用工具 fastp(质控), hisat2(比对), samtools(sam文件转bam文件), featureCounts(count计数...
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RNA-Seq STAR 比对学习1
最近使用STAR比对出现了状况，软件版本和对应的Index不相容，报错信息如下 原因是之前构建好的index是使用以前版本的STAR软件构建好的...
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RNA-seq数据的上游处理及工具HISAT2; STAR; RSEM; featureCounts; Htseq-count; kallisto; salmon
欢迎批评指正 一、上游处理流程 上游处理步骤包括质量检测、质量控制、比对、定量[2]，每一步处理数据的目的都是不同，也有相关的软件与之对应。通过...
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2021-02-14 ascp下载ENA数据库文件因为ENA跟NCBI的SRA数据是互通的，所以根据NCBI的SRP号就可以在ENA搜到相应的数据。目前好像无法由于存储位置的改变，无法直接用AS...
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详解多序列比对软件Jalview的使用方法，美化-编辑-自定义设计导语： 前面的推文简要介绍了Jalview的大体功能，本以为对该软件的需求不会很大。但是随着这几篇推文“，”中发现的一些问题，今天有必要对Jal...
专题公告
琐碎生信推文
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