寻找差异表达的基因并识别它们的功能，是我们进行RNA测序的最主要目的。很明显，这些差异的基因必然与功能改变密切相关，例如，比较患病个体与正常个体...

在笔记1中，完成了GO和KEGG的enrich，后面的可视化其实非常简单。 1.气泡图~ dotplot(ego,font.size=5,sho...

在单细胞数据分析中，比较棘手的一件事莫过于细胞类型的鉴定了：虽然细胞可以用聚类算法聚成好几类，每个类型的细胞是什么呢?这就考验技术了。其实我们介...

常用的分析方法： 过表征分析 (over representation analysis, ORA) ：先找出差异基因，再对差异基因进行如GO/...

记录基础操作，预防“老年痴呆”。 单细胞数据分析难免要对细胞分群下手，那让我们康康都有哪些基础知识吧： 一、基本函数： FindNeighbor...

Seurat - Dimensional Reduction Vignette 我们知道单细胞转录组数据一个主要的特点就是数据稀疏，维度较高。基...

1、原理简述： R是一套完整的数据处理、计算和制图软件系统。其功能包括：数据存储和处理系统；数组运算工具（其向量、矩阵运算方面功能尤其强大）；完...

刘小泽写于19.9.3字虽然少，都是干货 欢迎关注我们的公众号～_～我们是两个农转生信的小硕，打造生信星球，想让它成为一个不拽术语、通俗易懂的生...

01—研究背景 记得在两年前刚学生信时，和很多小伙伴一样，在做完差异基因分析或者进行基因特异性筛选时，发现结果有几百个甚至上千个基因。心里想，这...