关于原理部分和更详细的介绍，见HiC-Pro: Hi-C数据预处理高效工具[https://www.jianshu.com/p/40ab8cb3...
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HiC-Pro的Singularity简明使用指南
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比较Hi-C数据分析的计算方法基于Hi-C数据的深层挖掘和多组学联合分析已经成为了三维基因组领域的重要组成部分。而工欲善其事必先利其器，夯实基础方能垒砌高台。染色质构象各个层...
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HiC数据预处理后一些输出格式（整理中，欢迎补充）
Juicer的输出文件: merged_nodups.txt read1的FLAG，对应SAM的第二列，FLAG read1比对的contig，...
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三维基因组学研究之Hi-C1. 技术原理 基因组研究的维度可以分为很多种，例如下图所示 其中Hi-C是研究三维结构的一种方法。Hi-C技术源于染色体构象捕获（Chromo...
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Juicer:Hi-C数据处理分析（三）
从 .hic 文件提取数据 此功能由 Juicebox tools 的 dump 命令完成。https://github.com/aidenla...
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Juicer:Hi-C数据处理分析（二）写在前面 上一章我们得到了 .hic文件，从上图我们清楚的看出可以利用 juicer tools 对.hic 文件进行feature annot...
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Juicer:Hi-C数据处理分析（一）参考： [1]. Durand, N.C., et al., Juicer Provides a One-Click System for...
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02-Hi-C辅助基因组安装基因组组装 基因组是怎么组装的，目前的方法有什么局限性？为什么要进行基因组组装？是因为目前的测序方法，无论是一代、二代、三代都是借助于全基因组鸟...
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Hi-C数据质控原理
作者：ahworld链接：Hi-C数据质控原理来源：微信公众号-seqyuan著作权归作者所有，任何形式的转载都请联系作者。 Hi-C数据质控原...
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Hi-C文献解读15年3月发表的一篇高引文章https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4542312/ Cite...
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