此教程无需R语言 Step 1 确定需要检索的芯片 例如 GSE33006 Step 2 利用GEO2R分析差异基因 GEO2R https:/...
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前面几期已经完成了从TCGA表达谱/临床数据下载处理整合,本次对样本中的有annotations.txt的进行分析处理 在之前下载的表达文件中,...
上期(#TCGA系列#TCGA基因/miRNA表达谱及临床数据下载)介绍了使用TCGA 的API下载肿瘤表达谱及临床数据,本期来处理上期下载的...
前言 Canonical在4月发布了全新Ubuntu 18.04 LTS,新LTS(长期支持)将是一个专为个人、开发者及企业用户所优化的版本。在...
TCGA数据,指癌症测序数据,TCGA的全称为The Cancer Genome Atlas,癌症基因组图谱(TCGA)是美国国家癌症研究所(N...
The cancer genome atlas(TCGA)数据库储存20多种癌症的基因组数据,作为生信喵少不了要下载上面的数据来分析。写篇文章介...
前言 之前一直在用RTCGA包下载数据,看着永不更新的数据,心里总觉得怪怪的,于是下定决心重新学习一个好用的包——TCGAbiolinks。这个...
前面介绍了3种获取TCGA数据的方法:使用TCGA2STAT、TCGAbiolinks、RTCGA。这里再介绍一个包:RTCGAToolbox包...
ROC曲线在我的记忆中,是在本科三年级的循证医学课,预防医学课上学过的,现在已经很模糊了,但是好像需要用上,这一次来回顾下:ROC曲线(rece...