在微生态研究中，当我们做完16S或宏基因组测序等多样性测序后，想找出不同处理组之间差异物种或差异基因，一般常用的组间差异分析metastats（...

FAPROTAX是一款适用于对环境样本（如海洋、湖泊等）的生物地球化学循环过程（特别是碳、氢、氮、磷、硫等元素循环）进行功能注释预测的软件。我们...

网络分析背景知识 图是一种数据结构 图结构：是研究数据元素之间的多对多的关系。在这种结构中，任意两个元素之间可能存在关系。即结点之间的关系可以是...

介绍 三元图通常用于三组数据两两比较，可以展示三组间的相对基因表达或者物种丰度等。 三元图是重心图的一种，它有三个变量，但需要三者总和为恒定值...

经过前面几节的原始数据处理过程，得到了可以用于分析的数据，现在让我们开始微生物组数据分析可视化的第一步，绘制Alpha多样性指数图，喜欢的小伙伴...

在之前的几篇文章里，介绍了如何整合dada2的分析结果，并且已经通过MicrobiotaProcess包转化为了phyloseq对象，接下来先让...

phyloseq: 扩增子统计分析利器 phyloseq包对多类型数据的综合软件，并其对这些数据提供统计分析和可视化方法。 介绍   微生物数据...

导读 宏基因组分析分为物种分析和功能分析两大块。物种组成分析是物种分析中最基本最常见的分析方法。利用R语言堆叠图，我们可以将一个项目中所有样品的...

常见的堆砌条形图看腻了，试试冲积条形吧！！ 参考： 数据链接： 提取码: ejrr

1. 背景介绍 关于绘制临床研究报告中亚组分析的森林图，我过去几乎试过了所有可能的工具，最早用绘制meta分析森林图的方法绘制临床研究亚组分析森...