本文应该是第二全的WGCNA分析教程,参考了最新的文档。第一全的还在路上,会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上,...
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WGCNA其译为加权基因共表达网络分析。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module),并探索基因网络与关注的表型之间的关联,以及网络中的...
I. Network analysis of liver expression data from female mice: finding m...
刘小泽写于18.10.24最近开始写第一篇英文小论文,练练手,为将来写英文大论文做准备 目录 1 背景 Background Types of ...
这篇文章更多的是对于混乱的中文资源的梳理,并补充了一些没有提到的重要参数,希望大家不会踩坑。 1. 简介 1.1 背景 WGCNA(weight...
刘小泽写于18.10.10很早就见过它,但只是不明觉厉,直到昨天才开始认真了解是这样的:昨天上午看了一篇文献,讲冠心病的基因共表达分析,简而言之...
什么是WGCNA 1 样本聚类,查看是否有离群值 2. 找构建网络合适的阈值 左图纵轴:相关系数的平方,越高说明该网络越逼近无网络尺度的分布。右...
生信菜鸟团https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzMTEwODk0Ng==&mid=2247484540&id...
原理:WGCNA算法首先假定基因网络服从无尺度分布,并定义基因共表达相关矩阵、基因网络形成的邻接函数,然后计算不同节点的相异系数,并据此构建分层...
现在做转录组测序,看看差异基因,做做富集分析,再讨论下差异基因功能与自己研究性状或处理之间的关系,最后加简单的qPCR验证,这样的数据发SCI影...
专题公告
WGCNA