scRNA基础分析-1:安装包、导入数据、过滤质控 - 简书 scRNA基础分析-2:降维与聚类 - 简书 scRNA基础分析-3:鉴定细胞...
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寻找差异表达的基因并识别它们的功能,是我们进行RNA测序的最主要目的。很明显,这些差异的基因必然与功能改变密切相关,例如,比较患病个体与正常个体...
在笔记1中,完成了GO和KEGG的enrich,后面的可视化其实非常简单。 1.气泡图~ dotplot(ego,font.size=5,sho...
材料:一个只有gene name的表格 需求:KEGG富集分析 背景 功能富集分析:按照功能分类,将功能相近的基因/蛋白分到一起,并关联其生物学...
在单细胞数据分析中,比较棘手的一件事莫过于细胞类型的鉴定了:虽然细胞可以用聚类算法聚成好几类,每个类型的细胞是什么呢?这就考验技术了。其实我们介...
clusterProfiler是一个功能强大的R包,同时支持GO和KEGG的富集分析,是生信技能树[生信爆款入门课程]GEO数据挖掘的重点。为拓...
写作之友 基因和基因簇的功能谱 (functional profiles) 的统计学分析及可视化 G Yu, LG Wang, Y Han, Q...
文章转自:作者:周运来就是我 链接:https://www.jianshu.com/p/66c387e1de3d 来源:简书 著作权归作者所有。...
参考这篇ID转换不用怕,clusterProfiler帮你忙这篇详细讲了无参考基因组该怎么办,值得一看 简单介绍一下几种常用的ID:Ensemb...
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