Scanpy 是一个基于 Python 分析单细胞数据的软件包,内容包括预处理,可视化,聚类,拟时序分析和差异表达分析等。https://gen...
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处理单细胞不可避免的一个问题就是样本整合问题。那如何将不同器官,不同测序平台,不同物种之间的单细胞数据进行整合分析呢?Scanpy使用pytho...
什么是拟时序分析?拟时序(pseudotime)分析,又称细胞轨迹(cell trajectory)分析,通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分...
单细胞转录组数据分析|| scanpy教程:预处理与聚类 单细胞转录组数据分析|| scanpy教程:PAGA轨迹推断 单细胞转录组数据分析||...
专题公告
基于使用scanpy的单细胞处理流程