经历之前的三节，现在大家手上已经有了从NCBI或者ENA数据库下载好并转化成了Fastq格式的文件（可以看到我这里只有单端测序的文件，应该是这个...

安装配置conda 使用清华源下载sh脚本并安装 下载完成后直接运行脚本文件bash Miniconda3-latest-Linux-x86_6...

共线性：物种间的共线性是由于物种间产生分歧，从同一祖先继承来的遗传信息经过各自的进化后，仍保留了大量的高度相似序列。分析：通过基因/基因组序列基...

写在前面 前天，我写了一个 TBtools 插件，意在让所有人都能自主分析转录组测序数据，进而获得 基因表达量矩阵（TPM） 和 基因读段计数矩...

我们已经得到了一个表达矩阵，下面我们就用DEseq2筛选差异表达基因，并进行简单的visulization。 DESeq流程 第一步我们需要准备...

将染色体从contig/scaffold水平提升到chromosome水平是组装的最终目标。我们通常使用遗传图谱，光学图谱，HiC这些技术提供的...

根据已有的蛋白库，对从基因组上提取到的蛋白序列进行比对，从而获得相应的信息。 常用的数据库： Nr：NCBI官方非冗余蛋白数据库，包括PDB, ...

10.UpSet集合图绘制 清除当前环境中的变量 设置工作目录 使用UpSetR包绘制集合图 基础绘图 使用set.metadata参数添加元数...

Let PCA tell us 容量有限，饮那瓢最能代表弱水的。 Then which？ 对待数据的正确态度-----处理之前，要先了解它(RN...