前言 书接上一回： keep并不是像如下的那么简答的！ 这个指令的关键在于中间的sampleID文件的准备 --keepaccepts a sp...
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GWAS分析-说人话（6）keep提取我们需要的表型数据 II
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SAS数据的导入（2）
混合的输入样式和读取杂乱的原始数据 1.混合的输入样式 三种主要的输入样式：列表样式、列样式和格式化样式。可以混合使用。 parkname:列样...
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MTAG(multi-trait analysis of GWAS)又开始一个新的软件啦，大家是否有需要的？可以同一人群的不同trait做。咱们就开始吧~官网地址：URLs. MTAG software is a...
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全基因组关联分析学习资料（GWAS tutorial）
前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析（GWAS）原理的书籍或者文章推荐。 其实我个人觉得，做这个分析，先从跑流程开始，再去看原理。 为什么...
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全基因组关联分析（GWAS）-基本分析内容1、GWAS 流程 image.png数据质控• 1）按分型百分比条件过滤，多数文章剔除缺失率在20%以上的位点，样本量较大的群体中，可以将缺失...
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重演一篇傻瓜式GWAS分析|培养兴趣专用重演一篇傻瓜式GWAS分析|培养兴趣专用[https://zhuanlan.zhihu.com/p/139428767] 发布于 2020-05...
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使用GEMMA进行复杂性状全基因组关联分析(GWAS)GEMMA（Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm）是一款基于混合线性模...
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Linux命令学习手册-mount
功能 挂载文件系统。 描述 所的文件在unix系统中用树状的方式组织， mount 命令用于把从 device 上面发现的文件系统挂载到这个树状...
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GWAS后续分析：多基因风险评分(Polygenic Risk Score)的计算一、什么是多基因风险评分 传统的GWAS研究只计算单个SNP位点与表型之间的关联性，再用Bonferroni校正，通过给定的阈值，筛选出显著的S...
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多基因风险评分分析（Polygenic risk score）多基因风险评分是一个用来评估个体患某种疾病风险的方法，它是通过GWAS统计数据的基因型效应值来计算的。计算公式如下： n: 纳入的SNP的数量；...
专题公告
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