在之前的学习和练习里，比对这一步我使用过bowtie2（DNA比对）和hisat2（RNA-seq比对），现在学习另一个很火的软件：STAR。S...
投稿
收录了14篇文章 · 1人关注
-
比对软件STAR的使用
-
第2周：RNA-seq数据分析最佳实践原文来源：Conesa A, Madrigal P, Tarazona S, et al. A survey of best practices...
-
Hisat2,bwa,bowtie2,STAR,samtools的index之前只是自己用bowtie2和bwa建过index,直到这个东西的作用就是加快比对到参考基因组上的速度，但是不同比对软件的index是不通用的，...
-
【RNA-Seq 实战】四、序列比对这里是佳奥，让我们继续转录组分析的学习！ 常用的软件：hisat2、subjunc、star、bwa、bowtie2（主要针对基因组）等 1 s...
-
BLAST的简单使用教程
BLAST（Basic local alignment search tool），即基于局部比对算法的搜索工具 BLAST包括blastn, b...
-
原始数据上传NCBI-转录组数据经常碰到老师在文章接收过程中，编辑要求将原始数据上传NCBI，要是没有数据上传经验的不要慌，小编手把手教你如何快速上传数据至NCBI （一）NC...
-
blastn跟blastp用法（linux）
blastn blastp
-
生信常用数据库（三）：SwissProt和TrEMBL数据库搭建
前言 UniProt是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库，由两大部分组成，SwissProt和TrEMBL，SwissProt为高质量的、手...
-
用blast进行本地化搜索PHI数据库
PHI（pathogen host interactions）是一个病原菌和宿主互作的数据库，包含了许多已报道的病原菌致病相关基因的信息。网页版...
-
生信常用数据库（二）：NT数据库和NR数据库搭建
前言 NR和NT数据库是做序列比对经常用到的数据库，小编接下来带你在本地集群上搭建这两个数据库 下载 下载链接：Index of /blas...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1989073/WeChat_Screenshot_20220602111734.png', '推荐专题《序列比对》（ 分享自 @简书 ）','https://jianshuapi.com/c/13578260c118?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','页面编码gb2312|utf-8默认gb2312'));){kind=link}