adonis文档：https://www.rdocumentation.org/packages/vegan/versions/2.4-2/to...

导读 用Metabat2分箱的方法见：宏基因组分箱（二）Metabat2分箱实战[https://www.jianshu.com/p/72a60...

R Markdown 是Markdown在R中的延伸。除了具备一般Markdown 语法功能之外，最关键的是可以在Rmarkdown 中插入代码...

热图（heatmap）在生信领域基本就是常规操作，基本技能，入门操作。能画热图的工具也有很多，我自己常用的R包是pheatmap。 最近经常看见...

今天分享另外一个最近学习的一个画图的小技巧。 说到网络图的绘制，大家可能首先想到的是Cytoscape，它在生物学相关的领域应用非常广泛，我自己...

桑基图，其实我用的不太多。最近常见还是在分析单细胞数据的时候，展示细胞通讯用的比较多的一种类型的图。例如下面一张就是cellchat画的一张桑基...

本想着写一篇介绍论文中各种类型图表的推送，但是着笔介绍时又觉得不如一起绘图吧！各类学术图表都万变不离其宗，以图的形式将处理后的数据展示出来（主要...

前面一个帖子我们学习了画基本的PCA图形，但是是二维的，今天我们学习绘制三维的，因为在有些paper中看到作者放的是三维的，其实也挺好看的。主成...

前面，我们仔细学习了Alpha多样性的一些常见指数，今天我们尝试用R来计算这些常用指数。 library(vegan) library(pica...