这里是佳奥！我们继续学习最重要的三个R包。 1 scater Package(calculateQCMetrics已停用，用addPerCell...
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【单细胞转录组 实战】八、scater 、Seurat、monocle Package介绍
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单细胞转录组流程一：安装运行cellranger及结果解读
单细胞分析流程之Cell Ranger 相信做单细胞的小伙伴对Cell Ranger这个软件都不陌生，我们今天就来了解一下Cell Ranger...
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10×单细胞测序分析练习（一）目前单细胞测序获取细胞的方法主要有两种：（1）Smart-seq：测序细胞量少(因为一次通过一个细胞)，但是测序的reads数多；（2）Drop...
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单细胞转录组流程三：超详细！Scanpy打通单细胞常规流程有人可能会说：单细胞分析使用Seurat，monocle等R包会更加方便。但是实际分析中,测试情况是当细胞量大于5万时。一般小型服务器内存很容易...
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单细胞转录组流程二：超详细！ Seurat打通单细胞常规流程Seurat standard pipeline(10核心流程) 创建Seurat对象 Read10X CreateSeuratObjec...
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单细胞转录组数据 细胞注释指南
细胞注释是单细胞转录组分析的重要环节，来自加拿大的研究人员在《Nature protocols》发表细胞注释教程综述，介绍了单细胞转录组数据分析...
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FancyHeatmap - 基因表达量探索浏览器支持SVG输入了！写在前面 很久以前，我们推出《热图，还只会用方格子？@所有人，论文热图升阶的时候到了！》这一功能。目前已有一定的用户量。 只接受TGA格式的图像...
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简明教程 | 用 PPT 做卡通热图 - eFP Graph?!写在前面 不少人应该知道，在生物模式，通路，调控机制上，PPT 已然是常规工具之一。类似的，那么画卡通热图，PPT一样靠谱。我们知道，Adobe...
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【脚本搬运工】convert gbff to gff/fasta
写在前面从NCBI下载的注释文件通常是gbff格式的，而我们平时做上游分析用到的大多数为gff或gtf文件，那么这两种格式之间怎么进行转换呢。一...
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JGG | 国家基因库发表单细胞数据递交和可视化平台
2021年12月29日，Journal of Genetics and Genomics在线发表国家基因库生命大数据平台团队和深圳华大生命科学研...
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