环形RNA是一类在真核生物中广泛存在的具有特殊环状结构的非编码RNA分子。已有文献表明,在生物体内,环形RNA有着miRNA海绵、RBP海绵以及...
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环形RNA是一类在真核生物中广泛存在的具有特殊环状结构的非编码RNA分子。已有文献表明,在生物体内,环形RNA有着miRNA海绵、RBP海绵以及...
Find_circ工具是最早利用高通量测序数据预测环状RNA的开山鼻祖。该工具是Memczak等人2013年在权威Nature杂志上发表题为“C...
今天测试另一个环状RNA预测的重要软件——CIRCexplorer2。该软件是由中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈玲玲研究...
circRNA的生信分析根据鉴定的方法不同可以分为以下两种: split-alignment-based approaches:针对内含子驱动模...
通过spliced reads的mapping能发现线性RNA和环状RNA的剪切方式不同。一个是正常的5’/3’前后剪切,一个是反向的5’/3’...
随着去除核糖体测序技术深入发展,越来越多的环状RNA(circRNA)不断报道发现,基于生物信息学分析显示circRNA发挥着极其重要的生物学功...
cirRNA是非编码RNA中的一大类,它由一种非经典剪接方式——反向剪接(backsplicing)产生;当反向剪接发生时,下游剪接位点与上游剪...
专题公告
环状RNA