前言 本次主要使用Seurat比较STAR与Cellranger的输出结果,只会进行简单的聚类工作。 数据读入 数据比较 根据箱线图,直方图和矩...
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刘小泽写于19.10.24笔记目的:根据生信技能树的单细胞转录组课程探索Smartseq2技术及发育相关的分析课程链接在:http://jm.g...
刘小泽写于19.5.16分析单细胞数据,尤其是10X需要对barcode、UMI、拆分等名词进行了解,于是追根溯源,发现理解它的工作原理对后续分...
刘小泽写于19.4.3-4果然是大文章,内容比较丰富。热烈庆祝sci-hub合法化,这下大家可以自由自在使用了 之前的单细胞转录组研究中,许多实...
刘小泽写于19.4.1中午写到晚上,总共10个小时研究一篇综述,收获满满,还是看综述最给力,带领我们快速了解一个领域 这篇关于单细胞的综述发表于...
刘小泽写于19.4.4+4.7结合一篇文章+scater说明书,并做了一些个人修改 首先上文章和scater包说明书 来自https://f10...
刘小泽写于19.4.5许多单细胞分析包中都会遇到这个对象,那么说明书当然是最好的学习工具了 说明书地址:https://bioc.ism.ac....
刘小泽写于19.3.26这次主要内容是更新一下第四期的QC部分,另外简单看一下标准化(没有涉及流程),因此标题定了一个 四plus 慢慢翻开细枝...
刘小泽写于19.3.26陌生的领域就像一张白纸,怎么画就看自己了 前言 关于单细胞测序,我们已经知道了它和bulk RNA-seq的区别,简单说...
刘小泽写于19.3.16看了一篇综述,又加了一些扩展知识 文章 这是一篇2017发表在Genome Medicine上的文章A practica...
专题公告
单细胞转录组分析,新知识储备与学习