Introduction 宏基因组学是直接从环境样本(如土壤、水、肠道内容物等)中回收遗传物质并进行研究的学科,无需对个体生物进行分离或培养。这...
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Introduction 上一篇里通过Metabat2了解了宏基因组分箱的关键步骤,这篇文章将介绍一个更全面的binning流程:MetaWRA...
上次已经介绍过了使用R绘制系统发育树的基本用法[https://www.jianshu.com/p/b6c4d3376bc9],也埋下一个小坑:...
Logs 增加R包pctax内的一些帮助上游分析的小脚本(2024.03.03) 增加Mmseqs2用于去冗余,基因聚类的速度非常快,且随序列量...
Introduction ANI 是指平均核苷酸一致性(Average Nucleotide Identity),它是一种用来比较两种基因组之间...
Introduction GTDB(Genome Taxonomy Database)是一个专注于基因组分类学的数据库,旨在提供高质量的细菌、古...
Introduction 在生物信息学领域,对(宏)基因组进行生物合成基因簇(BGCs)的挖掘,编码次生代谢产物的生产已成为自然产物发现的关键策...
Introduction 了解控制群落多样性、功能、演替和生物地理学的机制是生态学,尤其是微生物生态学中的一个核心。推荐阅读综述: Zhou, ...
Introduction 上次简要介绍过了微生物组中生物合成基因簇(BGCs)分析[https://mp.weixin.qq.com/s/4eH...
我们实验室的子诺师姐开发了一种新型的用于个体生物和化学暴露组纵向测绘的可穿戴被动采样器:AirPie。目前可以在一个驱蚊扣差不多大小的devic...
专题公告
宏基因组相关分析方法,文章解读等