一:数据准备 自己去下载拟南芥的基因组,gff3,CDS序列,pep文件。 1.根据gff文件获得基因位置信息。 可以自己用awk抓,也可以写个...
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一:数据准备 自己去下载拟南芥的基因组,gff3,CDS序列,pep文件。 1.根据gff文件获得基因位置信息。 可以自己用awk抓,也可以写个...
一篇不知道拖了多久的笔记……欠下的债早晚还是要还的…… 0.软件下载及安装 官网: http://chibba.pgml.uga.edu/mcs...
1.简介: (1)介绍:MCScanX[http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/#tm]采用改进了的MCScan算...
MCScanX是检测基因共线性和进化分析的常用工具之一,2012发表至今引用数200+,作者之一的唐海宝老师是国内植物基因组学生信分析、软件开发...
写在前面 我受够了!整天有人问,TBtools怎么画这个图 但是我其实只想回一句: 你画这个图干什么?有什么意义?你想说谈什么生物学故事? 承认...
写在前面 类似的主题,我们已经推出了一篇主题为《一键完成共线性(MCScanX)分析》的文章。推出之后一部分人用着挺好。也有相当部分朋友却不知为...
共线性分析(Synteny analysis)及可视化 基因家族流程:基因家族分析(一)[https://www.jianshu.com/p/3...
目录MCScanX下载及安装数据准备MCScanX运行及结果Ka & Ks 计算下游画图脚本最后 MCScanX有两个主要的功能, 一是, 方便...
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