1. 认识序列。 序列(sequence): 就是字符串(string) s=abcdefghijklmnopqrstuvwxyz 通常用 代表...
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这篇文章很长,超过1万字,是本系列中最重要的一篇,因为我并非只是在简单地告诉大家几条硬邦邦的操作命令。对于新手而言不建议碎片时间阅读,对于有一定...
在WGS数据的分析过程中,我们会接触到许多生物信息学/基因组学领域所特有的数据文件和它们特殊的格式,在这一节中将要介绍的FASTA和FASTQ便...
前言 基因测序已是时下热门,目前除了华大基因之外,其他分布于全中国的大型测序平台(HiSeq X 10)还有约10个,每个每年大概能完成1.8万...
持续更新ing.....最后更新时间:2019/3/8 10:28 AM 1.linux命令 1.1 linux的权限 权限: eg: 7=4...
功能(GO)或者通路(Pathway)富集分析时,都会涉及到 Background; 做分析时,分析工具会提供一些数据供使用者选择或者使用自定义...
最近看文献的时候GSEA分析的出现频率太高了,我想我是不是也该学习一下。帖子看了不少,官方的user guide也看了,但是一直有个挥之不去的困...
该脚本适用于featureCounts数counts后的cpm和tpm计算 setwd("~/Desktop")#设置工作目录 countdat...
RPM/RPKM/FPKM/TPM是我们在定义表达量时常用的几种计算方式,那么究竟有什么区别呢? RPM/CPM RPM/CPM: Reads/...
序列比对和序列特征分析总目录 序列比对的根本是发现潜在的同源序列,为所查询的序列进行功能预测及三维结构建模奠定基础。 序列比对sequence ...
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