一、数据准备 首先，选取不同物种的Protein数据集：Arabidopsis_thaliana.fa；Citrus_grandis.fa；Di...
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基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建（上） -
基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建（下）最近刚返校，事情比较多，每天也很忙，之前写的《基因家族扩张与收缩分析及物种进化树构建（上）》也一直没来得及更新，缺少cafe输出结果的解读及后面...
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全基因组组装，注释与评估软件集锦（更新于2020.03.20）
1.Assembly 1.1质体基因组 1.1.1NOVOPlasty program language：Perl Reference： 10...
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48个实用的生信在线工具在线工具一般具有“功能强大、操作简单、无需安装、用完就走”的特点，轻松实现“用别人的服务器分析自己的数据”。 基因结构绘制 1.Exon-Int...
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基因家族分析之orthofinder后续结果的R分析基因树
利用orthofinder分析基因家族后，可以获得genetree和speciestree 结果。我们可以利用R包来可视化基因树和物种数，并对其...
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公共数据库挖掘之数据下载后处理
在上一篇简书中，我总结了如何下载数据链接如下：[公共数据库挖掘之利用R语言下载并整理GEO数据] https://www.jianshu.com...
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如何从NCBI下载基因组序列和注释文件并统计基因个数从NCBI下载一个物种的基因组文件。假设我们要下载一个叫做Tetranychus urticae的物种，首先在NCBI上genome中搜索Tet...
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1. python学习基础之注释、输入、输出、运算符
1. 注释： 单行注释 有快捷键crtl+/ """ 第一行注释 第二行注释 第三行注释 """ ''' 第一行注释 第二行注释 第三行注释 '...
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公共数据库挖掘之利用R语言下载并整理GEO数据因为是初次利用R包进行下载数据，其中遇到了各种问题，重装了几个R，终于可以顺利下载文件了。现在把过程整理总结如下，其中有问题的地方还希望大家一起...
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R语言操作和处理数据小总结
在R文本编辑器中输入数据 提取前5行 提取“Sepal.Length","Sepal.Width”两列的前5行 指定种子值 寻找重复值 查找哪一...
专题公告
自己学习生物信息学的一些作业和思考
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