安装配置conda 使用清华源下载sh脚本并安装 下载完成后直接运行脚本文件bash Miniconda3-latest-Linux-x86_6...
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转录组RNA-SEQ上游分析2020 -
使用STAR构建基因组比对索引--问题及解决方法来吧，生信搞起！ 首先拿到公司给的cleandata，使用STAR进行参考基因组比对，软件安装参考其他网站给的步骤； 下面是在建索引时遇到的问题...
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比对软件STAR【更新】STAR下载地址https://github.com/alexdobin/STAR[https://github.com/alexdobin/S...
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比对软件STAR的使用
在之前的学习和练习里，比对这一步我使用过bowtie2（DNA比对）和hisat2（RNA-seq比对），现在学习另一个很火的软件：STAR。S...
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高通量测序数据处理学习记录（零）：NGS分析如何选择合适的参考基因组和注释文件前言 现有比对工具在做mapping之前，都需要下载对应物种的参考基因组做index，而如何选择合适的参考基因组是一件非常重要的事情。 现有的参...
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RNA-seq：转录组数据分析处理（上）（2019/05/07更新）
superqun原创 一、流程概括 RNA-seq的原始数据（raw data）的质量评估 linux环境和R语言环境 raw data的过滤和...
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RNAseq教程(1.3)
目录 1.Module 1 - Introduction to RNA sequencing Installation[https://www....
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从下载数据开始完整跑hisat2-stringtie-提取表达矩阵参考文章：https://www.jianshu.com/p/1f5d13cc47f8https://davetang.org/muse/201...
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RNA-seq完整分析过程linux基本命令 第六章 Linux文件与目录管理 极客学院服务器 高通量相关基础知识 生信一百讲 1、 Anaconda Anaconda是...
专题公告
学习转录组上游处理
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