发简信
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使用泊松分布判定chipseq的蛋白结合位点
二项分布和泊松分布都描述的是事件成功次数的分布，泊松分布是二项分布的极限分布，其适用条件是n很大，p很小的情况。生物学中一些过程可以使用二项分布...
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使用viz-palette可视化你的配色方案
数据分析时我们经常会遇到多组treatment和control，多个细胞系，多种组学数据类型的情况，用ggplot或者matplotlib作图时...
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R语言 | 用image函数绘制热图heatmapR语言中绘制热图heatmap的包（package）有很多，除了许多炫酷的第三方包外，系统自带的image函数使用起来也十分方便灵活。 1.主要...
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RegulomeDB和HaploReg数据库：后GWAS时代的数据整合
RegulomeDB和HaploReg数据库提供了将大量基因组学数据与非编码突变整合的思路。 1.背景 GWAS研究产生了大量的SNP，大部分在...
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使用REST API批量下载ENCODE数据本篇主要内容 本篇主要介绍两种方法，搜索并批量下载ENCODE数据。 方法一：在页面中搜索并获取下载地址 进入ENCODE portal主页：h...
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玩转ENCODE项目的数据资源（一）本系列主要内容 介绍ENCODE的数据概况，在data portal上查询数据，使用REST API批量下载数据，参照ENCODE官方数据处理流...
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基因组学数据分析常用的在线资源
奋斗在人类组学数据分析的一线，要随时跟上最新的研究进展。大型的研究项目会有全面的数据集和可视化工具，也有专门从各个数据源收集数据整合而成的数据库...
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生物信息工程师的编程语言清单
作为一名生物信息“工程师”，日常的工作环境是基于Unix的计算机集群，因此最常用的就是shell脚本。它可以简单的处理数据，再加上迷你语言sed...