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TCGA-CRC下载数据 TCGA官网下载TCGA-COAD projiect的HTSeq-counts 和clinical的manifest文件。然后在电脑终...
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GEO数据库GEO数据库是什么? 1.GEO，全称Gene Expression Omnibus,中文名叫基因表达综合数据库，网址(https://www....
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TCGA生存分析
！！！每次跑完记得保存数据，昨天做完后就只是记录流程，结果数据没保存，幸好数据不是很大。。。。 俺卡住了，因为小洁老师用的meta文件和使用R包...
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用RTCGA包下载TCGA数据
所有的学习都是从模仿开始的，所以我又开始跟着小洁老师继续学习了。知识是日积月累的，希望自己走的每一步都是扎实的。 1.下载包及引用数据 让我们看...
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ppt绘制细胞图
使用工具：2010版ppt 参考文章用WPS，菜单栏找功能不太一样，具体步骤都是参照原文来。编辑顶点是是点击鼠标右键,就可以看到如下图： 我自己...
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使用 ezcox 展示森林图计算 先构造两个多变量 Cox 分析模型 mds <- get_models(zz) 查看模型结构，其实是列表而已 Show time 使用 s...
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Cox生存分析可视化-Forest plot（森林图） |今天学习用森林图展示COX生存分析 1.数据准备 数据格式如下 2.构建COX回归模型 对LIHC队列进行Cox回归分析，时间变量是time，结...
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「r<-包」使用 ezcox 进行批量 Cox 模型处理参考：「r<-包」使用 ezcox 进行批量 Cox 模型处理 knitr::kable(res)运行后会出现knitr1.png3 个 Cox...
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生存分析的R笔记基本概念 生存分析：从字面上就是让我们分析事件发生的速率，研究各个因素与生存时间有无关系及关联程度大小。主要描述3个内容： 1.研究生存过程 研...