发简信
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vs code更改默认终端 conda activate激活
缘起：今天想尝试在vs code中使用python，出现了几行warning，大意是conda无法激活。 总结经验： Anaconda可以看作是...
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Rnbeads包差异甲基化分析愚人节快乐。 导入数据，设置选项 hESCs vshiPSCs 注释文件路径 告诉软件测序数据是哪个平台的数据 测序数据路径（450K：idat...
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差异分析的检验方法前言 众所周知，当你所自己今年比去年更优秀的时候是不可以随便吹牛的，请把你在简书上发文的频率以及质量摆出来！ 面对今年和去年的数据，或许你需要一...
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如何从UCSC上下载注释文件以及gene_id相互对照文件下载注释文件（以hg19为例） 下载gene_id相互对照文件 UCSC上的注释文件还是非常全面的，clade选择大的分支，genome选择物种...
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回家了，bug来了[lt@localhost ~]$ java -version Error: dl failure on line 597 Error: fai...
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复盘总结（五）
今天做展示PPT的时候发现可以用一种更简单的方式计算之前计算过的内容，因此更新一下之前的结果。1.相关性分析结果 2.组织特异性甲基化的启动子区...
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复盘总结（四）
特异性分析 得到1495个组织特异性的启动子甲基化区域。（由12118个启动子甲基化区域得到）不重复的基因只有1392个，有一些基因在不只一个组...
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复盘总结（三）GTEX表达矩阵预处理 R语言学习：1.append添加新的列。2.R语言处理大规模数据速度不算快，通过安装其他包比如data.table可以提...
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复盘总结（二）
接复盘总结（一） methylkit R包上游处理 对甲基化位点进行注释、导出SPM分析上游文件 几点说明：1.启动子区域的选取：上下游250b...