在【r<-绘图|ROC】ROC的计算与绘制这篇文章中我讲了ROC曲线的本质以及如何计算和绘制ROC曲线。注意,我这里谈到的ROC并未曾涉及机器学习模型的拟合与预测,而是指存在...
写在前面 在很久很久以前,由于课题的需要,我写了一个Circos图绘制功能(在TBtools里《任何人!十分钟掌握Circos图绘制》)....从那以后,我就再也没用过。这是...
文献题目:RnBeads 2.0: comprehensive analysis of DNA methylation data DOI(url):https://doi.o...
欢迎关注公众号:oddxix 本次主要介绍一下DNA的甲基化和羟甲基化的高通量测序。DNA的甲基化是在DNA的序列不变的条件下,在其中某些碱基上加上甲基的这样一个过程。 DN...
PCA(Principal Component Analysis)主成分分析, 用来考察多个变量间相关性一种多元统计方法,研究如何通过少数几个主成分来揭示多个变量间的内部结构...
基本概念 1. 什么是DNA甲基化 DNA甲基化是表观遗传学的中最为常见的一种修饰,其主要形式包括:5-甲基胞嘧啶 (5-mC)、少量的N6-甲基腺嘌呤 (N6-mA) 以及...
刘小泽写于19.3.26陌生的领域就像一张白纸,怎么画就看自己了 前言 关于单细胞测序,我们已经知道了它和bulk RNA-seq的区别,简单说就是scRNA体现异质性(个体...
DNA甲基化是一种参与了许多疾病与生物学过程的表观遗传标记,对于脊椎动物而言,常见的形式就是核苷酸5号位的胞嘧啶添加1个甲基(5mC), CpG含量丰富的启动子区域的甲基化状...