基因-共线性的定义与常见算法原理 物种内的共线性分析文件准备（物种比对到自身的.blast文件，物种基因信息文件.gff文件），运行MCScanX，输出collinear和t...
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TBtools基因家族分析详细教程(3)基因家族成员的进化分析2 -
TBtools基因家族分析详细教程(2)基因家族成员的基本分析包括基因成员的序列特征分析（分子量等电点等）基于motif分析成员序列保守特征与可视化（蛋白与核酸，可用于挖掘未知，尤其是核酸水平-非编码水平的保守）基于domain分析成员...
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巨坑！真的不要拿着 BLAST 就开始筛同源基因~写在前面 现在是 08:42，上午，还有30分钟就要赶去暑期培训会场（广西南宁-含线上场），想着今天应该一天都挺忙，干脆这会简单写一个昨晚碰到的用户的有趣问题。 不要拿 BL...
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讲演推介 | GSAman人工矫正基因结构注释神器！写在前面 前述确定下来参与 CGMonline 首次线下年会，原本以为是去做个报告，后面提了做个技术培训，最后定下来是只做会前的技术培训。本次报告人非常多，据说每个人不到15...
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老师，您这个下载地址打不开的，没办法下载SSRMMD软件
使用SSRMMD便捷、迅速与准确地进行：SSR位点检测，多态性SSR筛选，与批量SSR引物设计
1.简介 SSRMMD (Simple Sequence Repeat Molecular Marker Developer) 是用Perl语言编写的软件，可以从组装序列（F...
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使用SSRMMD便捷、迅速与准确地进行：SSR位点检测，多态性SSR筛选，与批量SSR引物设计
1.简介 SSRMMD (Simple Sequence Repeat Molecular Marker Developer) 是用Perl语言编写的软件，可以从组装序列（F...
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疑惑解决 | 关于“重现 Nature Plant 番茄分支位点鉴定的 BSAseq 分析结果”前述，我们推了一份教程，《QTLseq数据分析，鼠标点点，复现 Nature Plant 番茄论文结果》，其中详细较少了如何使用 TBtools 的系列插件，在本地笔记本电脑...
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老师，为什么我用Primer Check没有显示出胶图的选项？只是给出了一个Primer Check Result而已，这是什么原因啊？
「Primer Check」支持「多态性」引物筛选了~~
写在前面 至此，「TBtools」中「分子辅助育种」相关的功能释放 30% 了。第一阶段结束。余下功能，预计等暑期慢慢释放。「功能开发」的难度。作为阶段结束推文，相对简单，是...
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「Primer Check」支持「多态性」引物筛选了~~写在前面 至此，「TBtools」中「分子辅助育种」相关的功能释放 30% 了。第一阶段结束。余下功能，预计等暑期慢慢释放。「功能开发」的难度。作为阶段结束推文，相对简单，是...
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植物研究常用的数据库总结
1.基因组综合研究数据库 数据库植物网址TAIR拟南芥http://www.arabidopsis.org/[http://www.arabidopsis.org/]SIGn...
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记录NCBI下载基因组的大坑写在前面 最近分析的物种由于国外品种与国内品种差异还是比较大，虽然大部分文章用的参考基因组都是以国外品种为主，但是由于考虑到目前我这边数据几乎全部都是来源于国内品种，因此在考...
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生物小工具本文主要介绍一些生物小工具,尤其是在文章中的，还有就是生物信息学方面的，总而言之，言而总之，希望能够帮助到大家。 关键词：生物信息学工具;绘图工具 1、itol用于对系统进化...
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Integrative Bioinformatics |「第二次」参与编写的「第一本」书籍出版了！写在前面 从某个角度上来说，「TBtools」基本长成一个相对常见的，偏向于大众化的生物信息学小工具。过去几年的不间断开发，不仅仅得到用户认可，也得到了部分生信科研工作者的认...
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TBtools | 在 Motifs 上标记 Domains 的覆盖状况~写在前面 最近在做一些序列分析，发现很久以前的一个看起来或许没啥用的功能，其实还是有用。大体就是，当我们在分析某个家族成员的时候，我们或许想知道，到底感兴趣的分支，相对于其他...
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插件 | 上课神器 Simple Screen Draw尽管我工作就一年半，但其实我给人上课却有七八年。一直以来，我就想有一个功能，可以直接在当前屏幕上“画画画”。这样会非常方便演示。找来找去，发现一个叫 Pointofix 的似...
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呼朋唤友 | 「TBtools」使用问题快速解决！写在前面 「TBtools」开发至今也有 7 年。七年之痒，说实话，不是没有。但感情总是比矛盾更深厚。虽然我现在已经很少有时间精力去查看「TBtools」在线社群的问题了，但...
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【动植物研究动态】20220529文献解读
Cell | 黄学辉/黄三文/韩斌/李家洋受邀发表作物驯化育种的遗传学研究综述[https://mp.weixin.qq.com/s/l2GEq3V9oUPhETPs7FnQ...
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您好！请问有没有比较好的分析软件推荐，全基因选择育种是不是只能做重测序才能进行后续分析，可不可以采用已有参考基因组的数据进行？
全基因组选择育种（GS）简介
全基因组选择（Genomic selection, GS）是一种利用覆盖全基因组的高密度标记进行选择育种的新方法，可通过早期选择缩短世代间隔，提高育种值（Genomic Es...
