问题的起因 看这篇文献中关于WGCNA的方法步骤的时候,中间有个分析一直看不明白他是搞的什么东西来选择hub基因。关于共表达网络分析,他使用的是WGCNA分析,下边分析的方法...
我这个人完全没办法在不了解算法的情况下用一个包,那样我会疯,可是网上居然完全找不到limma算法的讲解资料,全是介绍怎么用的。 可能我太初级了,这么简单的算法大概不值得一提…...
前言 limma的全称是:Linear Models for Microarray Data 需要阅读limma的官方说明:https://www.bioconductor....
写在前面 感谢califano-lab[https://github.com/califano-lab]团队将代码无私的分享出来=。=! 本流程需要一点点R语言与linux基...
写在前面,这篇文章主要整理自于Gene co-expression analysis for functional classification and gene–disea...
前情回顾:单细胞时代 || 细胞身份概念的演变[https://www.jianshu.com/p/c56313177a31]单细胞时代 || 从众病之王到希望之光[http...
转自:https://mp.weixin.qq.com/s/Yt9HwCrvsz4gAkieTWYjRQ[https://mp.weixin.qq.com/s/Yt9HwCr...
生信分析过程中的文件格式:除了原始测序数据fastq、fasta之外,还有基因组文件fasta格式,基因注释文件gtf格式。在分析的过程中还会有众多中间文件的生成,如bed、...
很牛逼的技术是指统计学方面还是代码能力方面
面试生信工程师4今年进行了三场比较有效的面试。 候选人一是中国农科院应届毕业硕士,干湿结合背景,生信技能基于兴趣自学所得。涉猎还比较多,学习能力不错,回答问题也很自信,多少能回答个七八分。即...
自定义方便些,一劳永逸
[R] 如何快速生成许多差异明显的颜色?这个需求真的太常见了!注意问题强调的几个关键词:一是快速,二是大量,三是差异明显。在生成大量元素比较图时要明显区分不同样本,比如宏基因组中的物种分析: 方法一:自定义 自定义...
Ctrl+↑ 历史命令检索 Ctrl+Alt+Shift+M 批量替换变量名 Ctrl+Shift+R 段落注释(方便折叠) 对双引号中间按下Tab键,快速列出文件名,方便读...