关于查找motif，目前有很多种软件可以进行预测。我所在的实验室通常使用FIMO（MEME套件里的一个），但是有很多文献里也提到了HOMER这个...

Cutadapt安装 基本命令 例子： 常用参数 参数详解 Removing adapters Adapter 移除 Anchored 5’ a...

人类胎儿的染色质开放细胞图谱(1)：Annotating cell types：通过利用 scRNA-seq 数据集，可以简化 scATAC-s...

Homolog是同源基因。 Orthologs,Orthologues 直系同源，是指不同物种之间的基因，起源于共同的祖先，基因功能可能一样，...

近年来，m6A RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一，不断有CNS的文章问世，国自然资助的项目数量也逐年上升。 m6...

1.文献信息 标题：Genetic drivers of m6A methylation in human brain, lung, heart...

exomePeak使用感受： 由于是R语言，因此真实项目数据跑起来耗时比较久；其次，peak calling与diff peak是两个独立的过程...

一、Chip-seq分析流程 二、数据、参考基因组、所需软件下载 1、参考基因组下载： 以二穗短柄草为例： https://genome.jgi...

一、增强子 所谓增强子（Enhancer），位于结构基因附近，是一类非编码DNA顺式作用元件，在真核生物的发育过程中通过结合转录因子、辅因子以及...

上一步骤（第6篇：重复样本的处理——IDR）用IDR对重复样本peaks的一致性进行了评估，同时得到了merge后的一致性的peaks——sam...